Тревога штатной системы охраны автомобиля или срабатывает автосигнализация Пандора ?

Потому что дистанционный запуск делается для прогрева/охлаждения и заблаговременно перед поездкой, а не находясь рядом.

Тревога чего: штатной охраны или пандоры? Машину с охраны снимаете брелком пандоры или штатным?

Во время запуска на несколько секунд включается запрет снятия с охраны в слейве, поэтому если открыть родным ключом будет тревога. Нужно подождать, пока в приложении отобразится, что двигатель запущен и пойдет отсчет времени работы

Если снимать с охраны брелком Пандора или с телефона, то просто глохнет, если штатным ключом, то не глохнет но срабатывает тревога по двери когда ее открываешь. Зачем вообще нужна эта задержка, ее можно убрать?

Нет убрать ее нельзя при снятии с охраны брелком Пандора, это программная логика работы. Зачем запускать автомобиль и тут же снимать с охраны?

Pandora VX-4G GPS v2, какие команды отправляются на сигнализации в приложении Pandora Online по кнопкам вкл\выкл таймерный канал? И помогите настроить выключение канала по команде 654, вроде настроил но не отключается. Канал CH1, он у меня используется в 1 и 5 таймерных блоках, но интересует именно 5-й, который должен отключать по команде 654 https://disk.yandex.ru/d/ReUn-IU_8BRvpA

В 1 блоке событие для включения и выключения канала одинаковые, так это работать не будет.
В 5 блоке настроена логика с импульсом 0,1 с и на канал СН8, а не СН1.

В 1 блоке события разные, да и он работает к нему вопросов нет. А по 5 да, перепутал, 6 посмотрите

Попробуй в 6 блоке прописать Действие 2 на включение канала аналогично 1 блоку. А то действие 1 выключить канал есть, а действия на включение канала нет.

Бесполезно https://disk.yandex.ru/d/kvdqwkaY9MAQvA

а может просто шестой блок выключить., и добавить в 1-й блок:
в событие срабатывания действия 1 - событие 2 - по 456, и в событие срабатывания действия 2 - событие 2 - по 654.