Форум по автобезопасности -
автосигнализации

По идее - коды-шифры связи с брелоками хранятся отдельно и никакие перепрограммирования блока их стереть не могут, даже полное обновление ПО блока... Вывод - что-то случилось с передачей информации между главным блоком и модулем связи... Возможно - подпалили входы-выходы главногно блока своим программатором... Или что-то потерлось в РППЗУ программ. Достаточно один бит потерять...
Тоже ничего хорошего - скорее всего есть проблемы с ПО (оно "посыпалось" после вмешательства через неродной программатор, возможно из-за аппаратно-программного сбоя в процессе обмена через этот программатор)... Проблемы со связью с брелоками тоже могут быть из-за сбоя ПО...

И судя по происходящему - пора везти в ближайший сервисный центр
http://www.starline.ru/service-centers/ на диагностику/ремонт :
а) главный блок
б) модуль связи (на всякий случай)

Ну или сначала домучить блок - попытаться полноценно обновить его ПО, затем сделать сброс на заводские настройки (настоятельно рекомендуется производителем для корректной работы после обновления), затем восстановить настройки до состояния тех, что были до обновления ПО...

__________________
Жизненное наблюдение: электроника-наука о контактах.
Аксиома установщика: То, что КРИВО установлено - работать РОВНО НЕ БУДЕТ никогда.